分享一篇發(fā)表在Nature?Chemical Biology上的文章，文章的題目為“A multiplex single-cell RNA-Seq?pharmacotranscriptomics pipeline?for drug discovery”，通訊作者為來自芬蘭奧盧大學(xué)的Daniela Ungureanu教授，研究方向是在正常和異常細(xì)胞生長（如癌癥）過程中由受體酪氨酸激酶控制的信號(hào)通路。
高級(jí)別漿液性卵巢癌（HGSOC）是最常見的卵巢癌類型，但患者對(duì)治療的反應(yīng)存在異質(zhì)性，導(dǎo)致治療困難。而現(xiàn)有的藥物篩選方法難以捕捉這種異質(zhì)性，限制了個(gè)性化治療的發(fā)展。因此作者開發(fā)了一種使用抗體-寡核苷酸偶聯(lián)物進(jìn)行活細(xì)胞的條形碼編碼，由此進(jìn)行高通量藥物轉(zhuǎn)錄組分析的流程，探究了45種藥物（涵蓋 13 種作用機(jī)制）對(duì)不同 HGSOC 模型的作用機(jī)制。使用這種工作流程能夠以單細(xì)胞分辨率對(duì)患者來源的腫瘤樣本進(jìn)行個(gè)性化檢測。
作者發(fā)現(xiàn)不同 HGSOC 模型對(duì)藥物的反應(yīng)存在差異，其中PI3K-AKT-mTOR 抑制劑引發(fā)了一種耐藥性反饋機(jī)制，導(dǎo)致受體酪氨酸激酶?(RTK)（如 EGFR）的激活。而對(duì)于具有CAV1和EGFR 表達(dá)的HGSOC，PI3K-AKT-mTOR 和 EGFR 抑制劑的協(xié)同作用能夠提高對(duì) HGSOC 細(xì)胞的殺傷力，減輕耐藥反饋。
總之，該研究開發(fā)了一種基于轉(zhuǎn)錄組測序的流程，可以有效地研究藥物對(duì)腫瘤細(xì)胞的影響，并發(fā)現(xiàn)新的治療靶點(diǎn)和策略。該研究為 HGSOC 的個(gè)性化治療提供了新的思路，該研究開發(fā)的單細(xì)胞藥物轉(zhuǎn)錄組測序流程可以應(yīng)用于其他癌癥的治療研究。
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https://www.nature.com/articles/s41589-024-01761-8
文章引用：10.1038/s41589-024-01761-8
