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JACS | 唾液酸化修飾在保護蛋白質結構和功能免受氧化應激損傷中的分子機制2025-04-03

分享的是一篇近期發表在期刊 JACS 上的文章。文章標題是“Sialylation Shields Glycoproteins from Oxidative Stress: Mechanistic Insights into Sialic Acid Oxidation and Structural Stability”,本文的通訊作者是來自南開大學化學學院的李功玉特聘研究員(研究方向:D-蛋白質譜分析)和付浩浩副研究(研究方向:分子模擬增強采樣算法和自由能計算)。

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唾液酸化是一種常見的蛋白質翻譯后修飾,發生在糖蛋白的?N– 和?O-糖末端。已發現的唾液酸在細胞分化、細胞增值、細胞凋亡、細胞間通信和免疫反應等多種生命活動中發揮重要作用。正常情況下蛋白質處于動態平衡狀態,但氧化應激會導致蛋白質的結構破壞和功能失調,從而引發包括癌癥、神經退行性疾以及代謝紊亂在內的多種疾病。蛋白質應對氧化應激的機制尚不完全清楚,唾液酸化被認為可以在一定程度上可以緩解氧化應激帶來的損傷,但其具體機一直未被完全闡明。

在本文中,作者通過一種微尺度低溫等離子體(microLTP)裝置,模擬了細胞中復雜的氧化應激環境,并結合高分辨率質譜分析(MS)和密度泛函理論(DFT)計算,首次完整繪制了兩種常見唾液酸(Neu5Ac 和 Neu5Gc)在自由基氧化條件下的氧化路徑圖。并進一步使用人轉鐵蛋白(hTF)作為模型,根據一系列 LC-MS/MS ?位點定位、唾液酸化特異性酶處理和 AIU-IM-MS 技術,確定了特定蛋白質的結構基序和唾液酸化模式。(Scheme 1

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Scheme 1. 深度自由基氧化揭示了末端唾液酸化對蛋白質氧化保護作用的分子基礎

microLTP 衍生的 ROS 的表征

作者設計了一個 microLTP 裝置,使用氦氣作為載體氣體生成了多種 ROS,包括羥基自由基(?OH)、超氧陰離子(O??)、單線態氧(1O?)和過氧化氫(H?O?)。隨后,使用 EPR 波譜和其他分析技術對其產生的 ROS 進行了系統表征,結果顯示 H?O? 和 1O? 是主要的 ROS,濃度范圍分別為 10–180 μM 和 24–240 μM,而 O?? 和 ?OH 的濃度較低,分別為 40–120 μM 和 1–28 μM。

優化研究表明,microLTP 處理時間和外部高壓功率幅度會顯著影響 ROS 的產生。在相同條件下,ROS 豐度順序為:H?O? > O?? > 1O? > ?OH。通過調控 microLTP 參數可生成特定濃度范圍的 ROS,為后續實驗確定了 ROS 生成的最佳條件。

唾液酸的深度自由基氧化

為了探索與傳統氧化相比,唾液酸氧化途徑及其所得產物的潛在差異。作者首先選擇了 H?O?/UV 引發糖環裂解和 Baeyer-Villiger 重排,隨后生成脫羧產物 DSA,DSA 進一步氧化為羧酸/酮類衍生物。該結果展現出與傳統研究一致的化學氧化路徑:H?O? 對羰基進行親核加成,隨后 α-羥基過氧化物(αHHP)發生裂解(圖?1a)。隨后作者通過 microLTP 裝置對 Neu5Ac 進行實驗,發現在自由基激發時,側鏈逐步氧化(羥基→醛基(步驟 I,圖?1b)→羧酸(步驟 II,圖?1b)同時,作者還發現了一種競爭性氧化途(步驟 III,圖?1b)。雖然整個過程與化學氧化相似,但該反應過程涉及獨特的側鏈氧化,同時保持完整的聚糖環結構(圖?1c)。正如預期的那樣,步驟 III 的所得產物在充分的自由基氧化后發生最終的開環反應(步驟 IV,圖?1b)。由于羥基氧化的無偏倚性,步驟 I 生成了各種結構異構體,因此很難確定最終產物結構。

為了探究反應機理,作者計算了反應中間體的自由能(圖?1d-f),結果表明與不同量的 O? 反應時,會產生不同的穩定異構體產物和反應路徑。Neu5Ac 與 Neu5Gc 的羥基差異如圖?1g?所示,作者進一步測量了 Neu5Ac 與 Neu5Gc 的氧化動力學曲線,發現 Neu5Gc 因多一個羥基而表現出更強的抗氧化能力。

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圖?1. 發現唾液酸的自由基氧化途徑

如?Scheme 2?所示,作者通過 microLTP 生成了 Neu5Ac 氧化的 46 種中間體和產物,包括側鏈氧化(步驟 I–III)和環斷裂(步驟 IV)的逐步路徑,并通過 DFT 計算和質譜驗證了各步驟的異構體及熱力學穩定性。

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Scheme 2. Neu5Ac 的 46 種自由基氧化產物圖譜

hTF 的唾液酸化依賴性結構穩定性

作者為了探索蛋白質結構穩定性在自由基氧化影響下對唾液酸化和糖基化的依賴性,通過天然質譜和 AIU-IM-MS 進行了一系列氣相展開實驗(圖?2a-j),對 hTF 樣品進行了唾液酸化和?N-糖基化特異性酶處理(圖?2k)。非變性 MS 證實,唾液酸酶能有效去除 hTF 中的唾液酸化,但 PNGase F 去除 hTF 中?N-糖的效率較低(圖?2a-c)。通過鑒定酶處理產物,能夠比較氧化應激下唾液酸化的效應(圖?2c、f)。自由基氧化使蛋白質質量略有下降(圖?2a、d)。而去除唾液酸后,氧化時蛋白質質量的常規增加進一步支持了這一推測(圖?2b、e)。

傳統 CIU 為 hTF 產生了不同的電荷態依賴性去折疊模式,當將數據集轉換為 AIU 模式(圖?2g)時,可以直接明確地比較具有不同處理的 6 個 hTF 樣本的去折疊行為。通過比較氧化后 hTF 的 CCS、AIU5 和 RMSD 數據,發現唾液酸化顯著提升了蛋白抗氧化的能力。

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?2. 唾液酸化和?N-糖基化對氧化應激的 hTF 結構穩定性的影響

唾液酸化 hTF 的自由基氧化曲線

為了確定唾液酸化在抗蛋白質氧化應激中的作用,作者用唾液酸酶和 PNGase F 酶處理各種 hTF 樣品,以選擇性去除唾液酸和 ?N-糖基化,然后進行 LC-MS/MS 測量以鑒定和定量自由基氧化位點。

根據酶處理后的氧化水平變化,將鑒定出的肽分為兩類:上調(I)和下調(II)。I 組肽(如 47-60、531-541等)氧化水平顯著上調,對自由基氧化反應性更高;II 組肽(如 70-107、123-132等)氧化程度顯著降低(圖?3a)。從 hTF 的 3D 結構來看(圖?3b、c),I 組肽大多位于 C 端且靠近糖基化位點(Asn432 和 Asn630),說明糖基化可能對抵抗主鏈氧化有保護作用;而 II 組肽氧化水平降低可能是因為去除游離寡糖后結構重排造成的。這些結果進一步揭示了糖基化修飾和氧化作用在影響蛋白質結構穩定性方面的復雜相互作用。

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圖?3. 受唾液酸化和?N-糖基化調節的 hTF 的自由基氧化曲線

此外,作者以時間分辨自由基處理方式分析了具有唾液酸化和?N-糖基化的天然 hTF 樣品在不同時間(30、60 和 120 秒)的氧化位點,結果顯示,蛋白質多個區域(如肽段 144-162、226-239 等)存在顯著的劑量依賴性修飾(圖?4a)。將氧化位點映射到 hTF 的 3D 結構中發現,N 端和其他非糖基化區域優先被氧化(圖?4b)。

隨后,作者還全面表征了在不同血漿處理時間下在 Asn432 和 Asn630 位點的糖型變化(圖?4c、d),發現有唾液酸化的糖在 Asn432 和 ?Asn630 位點隨時間增加而減少,且不同數量的唾液酸化糖型比例進一步證明了唾液酸化糖的氧化降解。

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圖?4. 天然 hTF 自由基氧化位點的時間分辨標測

綜上所述,本研究首次揭示了唾液酸化修飾在保護蛋白質結構和功能免受氧化應激損傷中的分子機制。這一發現不僅為理解糖基化在細胞應激中的作用提供了新的視角,還為開發更穩定的蛋白質藥物開辟了潛在的創新方向。

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本文作者:WXL

原文鏈接:

https://pubs.acs.org/doi/10.1021/jacs.4c14454

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