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JACS | 一種易于獲取3FaxNeu5Ac和光交聯(lián)唾液酸轉(zhuǎn)移酶探針的動(dòng)力學(xué)方法2024-11-16
分享一篇發(fā)表在JACS上的文章:“A Kinetic Trapping Approach for Facile Access to 3FaxNeu5Ac and a Photo-Cross-Linkable Sialyl transferase Probe”,其通訊作者是阿爾伯塔大學(xué)的Matthew S. Macauley博士,他對糖類物質(zhì)的研究充滿熱情,這不僅體現(xiàn)在他的研究工作中,也延伸到了教學(xué)和指導(dǎo)學(xué)生等多個(gè)方面。

 

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唾液酸?(Neu5Ac) 是一種九碳α-酮酸單糖。唾液酸轉(zhuǎn)移酶 (ST) 將胞苷單磷酸-Neu5Ac (CMP-β-D-Neu5Ac) 的Neu5Ac安裝到哺乳動(dòng)物細(xì)胞的糖綴合物上。探測單個(gè)ST家族成員的化學(xué)工具受到科學(xué)家們的關(guān)注,而具有細(xì)胞活性的ST抑制劑是基于3FaxNeu5Ac (3) 支架的分子,它在細(xì)胞內(nèi)代謝轉(zhuǎn)化為CMP-3FaxNeu5Ac (5)。氟的軸向性很關(guān)鍵,但在這特定方向安裝氟是有挑戰(zhàn)的。

化學(xué)合成法存在步驟多、收率低,需通過色譜純化來分離3Fax和3Feq異構(gòu)體等缺陷。由醛縮酶介導(dǎo)的化學(xué)酶法也存在反應(yīng)可逆、受熱力控制、需色譜純化異構(gòu)體等不足。于是,作者提出通過聯(lián)用唾液酸醛縮酶與CMP-唾液酸合成酶來捕獲3Fax的動(dòng)力學(xué)產(chǎn)物,并以60%的收率獲得了CMP-3FaxNeu5Ac(Scheme 1)。

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Scheme 1. 動(dòng)力學(xué)捕獲CMP-3FaxNeu5Ac

 

化合物5在酸性條件下不能直接轉(zhuǎn)化成3,而是先生成7?(3Fax-Neu5Ac-2P),然后經(jīng)堿性磷酸酶?(ALP)催化獲得目標(biāo)產(chǎn)物。為了量化F緩解5水解的程度,作者進(jìn)行了基于MS 的動(dòng)力學(xué)分析,分別將25水解成17,結(jié)果發(fā)現(xiàn)C3位置的F取代使水解速率降低了約100倍(圖1)。

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圖1. 通過中間體7將 CMP-3FaxNeu5Ac (5)轉(zhuǎn)換為3FaxNeu5Ac (3)

 

隨后,作者在U937細(xì)胞測試3a,發(fā)現(xiàn)它能有效降低Siglec-1, -2, -3, -5, -7, -8和-15的唾液酸聚糖配體水平(圖2)。

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圖2. 3FaxNeu5Ac降低細(xì)胞內(nèi)Siglec配體水平

 

接下來,作者檢驗(yàn)動(dòng)力學(xué)捕獲方法能否有效獲得5的衍生物。如Scheme 2所示,作者通過級聯(lián)酶法順利獲得兼具光交聯(lián)基團(tuán)和點(diǎn)擊手柄的雙官能衍生物。相比之前的合成方法,該新型化學(xué)酶法,步驟少、產(chǎn)率高。

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Scheme 2. CMP-9-N-DAz-3FaxNeu5Al (11) 的合成

 

接下來,作者將光交聯(lián)探針11與三種人源重組的ST:ST6GAL1, ST3GAL1和ST3GAL4進(jìn)行UV交聯(lián)測試。首先,作者使用11與三種高濃度 (500 μM) 的ST進(jìn)行測試,觀察到11對ST6GAL1產(chǎn)生強(qiáng)的UV依賴性光交聯(lián),對ST3GAL4有最弱的UV依賴性光交聯(lián),且與ST3GAL1無光交聯(lián)。隨后,降低11的濃度,發(fā)現(xiàn)11對ST3GAL1有明顯的選擇性,甚至只需10 μM?11可實(shí)現(xiàn)與兩者的光交聯(lián)。當(dāng)增加CMP-Neu5Ac (2) 的濃度時(shí),11對ST6GAL1活性位點(diǎn)的特異性會(huì)被競爭性抑制(圖3)。

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圖3. ST6GAL1與11的選擇性光交聯(lián)

 

最后,作者評估了化合物115對ST6GAL1, ST3GAL1和ST3GAL4的抑制強(qiáng)度和親和力。結(jié)果表明,與5相比,11對ST6GAL1的抑制力稍有增加;對ST3GAL4有相似的抑制強(qiáng)度;對ST3GAL1缺乏抑制效力。另一面,11與ST3GAL1的結(jié)合較差,與ST6GAL1, ST3GAL4有相似的結(jié)合強(qiáng)度(圖4)。

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圖4.?511對三個(gè)ST的親和力和抑制力測量

 

總之,作者報(bào)告了一種快速、精準(zhǔn)合成ST探針 (CMP-3FaxNeu5Ac) 的動(dòng)力學(xué)方法,并且驗(yàn)證了該方法可用于獲得C5, C9位置改造的探針,及其能實(shí)現(xiàn)不同ST間的選擇性交聯(lián)。

 

 

文章作者:YX

原文鏈接:https://pubs.acs.org/doi/10.1021/jacs.4c10835

責(zé)任編輯:WXL

 

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