分享一篇發表在Angew上的文章“Discovering Cell-Targeting Ligands and Cell-Surface Receptors by Selection of DNA-Encoded Chemical Libraries against Cancer Cells without Predefined Targets”。本文共3位通訊作者,分別為香港大學的李笑宇教授、中科院上海藥物所的陸曉杰研究員、深圳灣實驗室的李剛特聘研究員。李笑宇、陸曉杰課題組主要基于DNA編碼文庫技術進行藥物、探針等功能小分子的篩選;李剛課題組致力于基于化學標記的功能蛋白質組學研究。

能與特定細胞結合的小分子在癌癥診斷和治療中有著廣泛的應用。針對活細胞篩選大型化學文庫是發現細胞靶向配體的有效策略。DNA編碼化學文庫(DEL)技術已成為藥物發現的有力工具,并已成功用于確定生物靶標配體。然而,幾乎所有的DEL篩選都有預先定義的靶點,而對整個細胞表面進行靶點識別的DEL 篩選仍未得到充分探索。在此,作者系統地優化了一種基于細胞的DEL篩選方法,該方法通過引入含光交聯基團的通用反義DNA鏈,將小分子文庫與靶點之間的非共價相互作用轉化為共價相互作用,進而顯著提高親和篩選的效率。

針對分別代表高轉移性和低轉移性的MDA-MB-231和MCF-7乳腺癌細胞,作者篩選出了具有1.0496億成員的DEL文庫,從而鑒定出了多種細胞特異性小分子,并將其應用于癌癥光動力療法和靶向給藥。對其中親和力最強的5號化合物,作者使用SILAC定量蛋白質組學技術,確定α-烯醇化酶(ENO1)是其細胞表面受體,并證明兩者間的Kd可低至100 nM。

綜上所述,這項工作提供了一種利用 DELs 發現細胞靶向小分子配體的有效方法,并證明了 DELs 可以成為識別癌細胞特異性表面受體的有用工具。
https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/anie.202421172