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JACS | 一種易于獲取3FaxNeu5Ac和光交聯唾液酸轉移酶探針的動力學方法2024-11-16
分享一篇發表在JACS上的文章:“A Kinetic Trapping Approach for Facile Access to 3FaxNeu5Ac and a Photo-Cross-Linkable Sialyl transferase Probe”,其通訊作者是阿爾伯塔大學的Matthew S. Macauley博士,他對糖類物質的研究充滿熱情,這不僅體現在他的研究工作中,也延伸到了教學和指導學生等多個方面。

 

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唾液酸?(Neu5Ac) 是一種九碳α-酮酸單糖。唾液酸轉移酶 (ST) 將胞苷單磷酸-Neu5Ac (CMP-β-D-Neu5Ac) 的Neu5Ac安裝到哺乳動物細胞的糖綴合物上。探測單個ST家族成員的化學工具受到科學家們的關注,而具有細胞活性的ST抑制劑是基于3FaxNeu5Ac (3) 支架的分子,它在細胞內代謝轉化為CMP-3FaxNeu5Ac (5)。氟的軸向性很關鍵,但在這特定方向安裝氟是有挑戰的。

化學合成法存在步驟多、收率低,需通過色譜純化來分離3Fax和3Feq異構體等缺陷。由醛縮酶介導的化學酶法也存在反應可逆、受熱力控制、需色譜純化異構體等不足。于是,作者提出通過聯用唾液酸醛縮酶與CMP-唾液酸合成酶來捕獲3Fax的動力學產物,并以60%的收率獲得了CMP-3FaxNeu5Ac(Scheme 1)。

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Scheme 1. 動力學捕獲CMP-3FaxNeu5Ac

 

化合物5在酸性條件下不能直接轉化成3,而是先生成7?(3Fax-Neu5Ac-2P),然后經堿性磷酸酶?(ALP)催化獲得目標產物。為了量化F緩解5水解的程度,作者進行了基于MS 的動力學分析,分別將25水解成17,結果發現C3位置的F取代使水解速率降低了約100倍(圖1)。

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圖1. 通過中間體7將 CMP-3FaxNeu5Ac (5)轉換為3FaxNeu5Ac (3)

 

隨后,作者在U937細胞測試3a,發現它能有效降低Siglec-1, -2, -3, -5, -7, -8和-15的唾液酸聚糖配體水平(圖2)。

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圖2. 3FaxNeu5Ac降低細胞內Siglec配體水平

 

接下來,作者檢驗動力學捕獲方法能否有效獲得5的衍生物。如Scheme 2所示,作者通過級聯酶法順利獲得兼具光交聯基團和點擊手柄的雙官能衍生物。相比之前的合成方法,該新型化學酶法,步驟少、產率高。

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Scheme 2. CMP-9-N-DAz-3FaxNeu5Al (11) 的合成

 

接下來,作者將光交聯探針11與三種人源重組的ST:ST6GAL1, ST3GAL1和ST3GAL4進行UV交聯測試。首先,作者使用11與三種高濃度 (500 μM) 的ST進行測試,觀察到11對ST6GAL1產生強的UV依賴性光交聯,對ST3GAL4有最弱的UV依賴性光交聯,且與ST3GAL1無光交聯。隨后,降低11的濃度,發現11對ST3GAL1有明顯的選擇性,甚至只需10 μM?11可實現與兩者的光交聯。當增加CMP-Neu5Ac (2) 的濃度時,11對ST6GAL1活性位點的特異性會被競爭性抑制(圖3)。

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圖3. ST6GAL1與11的選擇性光交聯

 

最后,作者評估了化合物115對ST6GAL1, ST3GAL1和ST3GAL4的抑制強度和親和力。結果表明,與5相比,11對ST6GAL1的抑制力稍有增加;對ST3GAL4有相似的抑制強度;對ST3GAL1缺乏抑制效力。另一面,11與ST3GAL1的結合較差,與ST6GAL1, ST3GAL4有相似的結合強度(圖4)。

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圖4.?511對三個ST的親和力和抑制力測量

 

總之,作者報告了一種快速、精準合成ST探針 (CMP-3FaxNeu5Ac) 的動力學方法,并且驗證了該方法可用于獲得C5, C9位置改造的探針,及其能實現不同ST間的選擇性交聯。

 

 

文章作者:YX

原文鏈接:https://pubs.acs.org/doi/10.1021/jacs.4c10835

責任編輯:WXL

 

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